رهبر معظم انقلاب در پیامی درگذشت آیت‌الله محمد یزدی را تسلیت گفته و بیان داشتند: ایمان راسخ به مبانی انقلاب و استقامت در این راه و غیرت دینی و انقلابی، نشانه‌های بارز دیگری از این شخصیت مکرم بود و امید است این وزن سنگین ذخیره‌ معنوی مایه‌ علو درجات ایشان باشد.