گمانه زنی های متعددی ازجمله اشتباه خلبان، نقص هواپیما، ربوده شدن و تروریسم مطرح شده که احتمال آخر به دلیل وجود 2 مسافر با گذرنامۀ مسروقه در این هواپیماست. البته بعد از آن که مقامات مالزی مشخص کردند که یکی از این 2 نفر از پناهجویان، ایرانی بوده نظریه وجود دست تروریسم در پشت این حادثه کمرنگ شد.